Подскажите, можно ли считать ПИР для госэкспертизы по договорной цене, или нужно руководствоваться справочником базовых цен?

Можно.
Но при малой стоимости ПИР могут насчитать стоимость экспертизы не в процентах от ПИР, а больше.

psm, если работа за счет собственных средств - стороны могут договориться по любой схеме, для бюджетных средств - смета ПИР.

andleo писал(а):могут насчитать стоимость экспертизы не в процентах от ПИР

Если это ГЭ то расчет цены (%) за нее определяется из Цпир в уровне 2001г, полученной на основании документов в области сметного нормирования и ценообразования.